Nuevo estudio: reconstrucción 3D del genoma de mamut lanudo de 52,000 años con piel liofilizada

MadridUn grupo de científicos internacionales ha logrado un descubrimiento importante al reconstruir el ADN y las estructuras cromosómicas tridimensionales de un mamut lanudo de 52,000 años. Lo consiguieron estudiando el ADN de una muestra de piel muy bien conservada. Este hallazgo es de gran relevancia.
- El ADN del mamut lanudo se conservó en estado liofilizado.
- Primera reconstrucción 3D del ADN antiguo en esta escala.
- Se analizó una muestra de hace 52,000 años.
- El ADN se extrajo de una muestra de piel detrás de la oreja del mamut.
El equipo utilizó una técnica llamada Hi-C para identificar las interacciones entre diferentes partes del ADN dentro del núcleo celular. Esta técnica les permitió crear un mapa detallado del genoma del mamut al compararlo con los genomas de los elefantes actuales. Hi-C es especial porque no solo muestra la secuencia del ADN, sino también la estructura tridimensional y la disposición del genoma en células vivas.
El estudio reveló que el mamut lanudo tenía 28 cromosomas, un número similar al de los elefantes asiáticos y africanos actuales. Los cromosomas fosilizados mostraron estructuras detalladas, incluyendo pequeños lazos que conectan factores de transcripción con los genes que regulan. Este nivel de detalle nos ayuda a comprender cómo estaba organizado el genoma del mamut.
Las células de la piel del mamut mostraban actividad genética diferente en comparación con el elefante asiático. Esto incluye genes que podrían haberle ayudado a desarrollar un pelaje lanoso y a sobrevivir en climas fríos. Por primera vez, los investigadores tienen tejido de mamut que revela cuáles genes estaban activados y cuáles desactivados.

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Este trabajo podría ayudar a estudiar otro ADN antiguo, como el de las momias egipcias o especímenes de museos. Aunque requiere muestras muy bien preservadas, abre una nueva vía para explorar la composición genética de seres antiguos.
Estos hallazgos son cruciales para los proyectos que buscan resucitar al mamut lanudo. Comprender qué genes estaban activos proporciona a los científicos información valiosa sobre las características únicas de estos animales.
Este estudio es de gran importancia. Presenta una nueva rama de la paleogenómica que no solo necesita fragmentos de ADN deteriorados, sino que también examina la estructura interna de los seres antiguos. Ha llegado el momento de ir más allá de las secuencias de ADN para comprender mejor los genomas ancestrales. Esto es solo el comienzo, y me entusiasma ver lo que depara el futuro.
El estudio se publica aquí:
http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2024.06.002y su cita oficial - incluidos autores y revista - es
Marcela Sandoval-Velasco, Olga Dudchenko, Juan Antonio Rodríguez, Cynthia Pérez Estrada, Marianne Dehasque, Claudia Fontsere, Sarah S.T. Mak, Ruqayya Khan, Vinícius G. Contessoto, Antonio B. Oliveira Junior, Achyuth Kalluchi, Bernardo J. Zubillaga Herrera, Jiyun Jeong, Renata P. Roy, Ishawnia Christopher, David Weisz, Arina D. Omer, Sanjit S. Batra, Muhammad S. Shamim, Neva C. Durand, Brendan O’Connell, Alfred L. Roca, Maksim V. Plikus, Mariya A. Kusliy, Svetlana A. Romanenko, Natalya A. Lemskaya, Natalya A. Serdyukova, Svetlana A. Modina, Polina L. Perelman, Elena A. Kizilova, Sergei I. Baiborodin, Nikolai B. Rubtsov, Gur Machol, Krisha Rath, Ragini Mahajan, Parwinder Kaur, Andreas Gnirke, Isabel Garcia-Treviño, Rob Coke, Joseph P. Flanagan, Kelcie Pletch, Aurora Ruiz-Herrera, Valerii Plotnikov, Innokentiy S. Pavlov, Naryya I. Pavlova, Albert V. Protopopov, Michele Di Pierro, Alexander S. Graphodatsky, Eric S. Lander, M. Jordan Rowley, Peter G. Wolynes, José N. Onuchic, Love Dalén, Marc A. Marti-Renom, M. Thomas P. Gilbert, Erez Lieberman Aiden. Three-dimensional genome architecture persists in a 52,000-year-old woolly mammoth skin sample. Cell, 2024; 187 (14): 3541 DOI: 10.1016/j.cell.2024.06.002

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